291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3119 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.6 
 
 
221 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
229 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  43.37 
 
 
171 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.1 
 
 
227 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24760  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.62 
 
 
229 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0083  flavin reductase domain-containing protein  34.55 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.32 
 
 
169 aa  143  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1579  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.51 
 
 
176 aa  142  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1124  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.33 
 
 
236 aa  138  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.373521  hitchhiker  0.0000000875399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.46 
 
 
216 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0013  flavin reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.329029  normal  0.100605 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  32.84 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  31.25 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  26.57 
 
 
164 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  32.39 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.7 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.29 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.29 
 
 
160 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  27.59 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  29.53 
 
 
575 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.77 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  24.65 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.52 
 
 
574 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.86 
 
 
575 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  27.92 
 
 
574 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  28.87 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  25.17 
 
 
160 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
149 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  25.87 
 
 
160 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.52 
 
 
576 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
149 aa  62.4  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.52 
 
 
576 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  27.56 
 
 
592 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.46 
 
 
159 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 
591 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.13 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  26.62 
 
 
582 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  27.33 
 
 
579 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  26.43 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  28.57 
 
 
572 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  24.66 
 
 
185 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  27.27 
 
 
163 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  27.97 
 
 
170 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3786  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.76 
 
 
50 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00367379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  26.14 
 
 
162 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.28 
 
 
575 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25 
 
 
191 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.5 
 
 
575 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.5 
 
 
575 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  27.15 
 
 
160 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  27.15 
 
 
160 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.08 
 
 
159 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25 
 
 
155 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  26.95 
 
 
160 aa  58.5  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  24.31 
 
 
162 aa  58.2  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.56 
 
 
316 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  25.38 
 
 
162 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  26.17 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  25.32 
 
 
638 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.89 
 
 
159 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  23.61 
 
 
174 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  22.22 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  23.94 
 
 
168 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2668  flavin reductase domain-containing protein  25.98 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.34 
 
 
181 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.76 
 
 
170 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48766  predicted protein  19.86 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  26.9 
 
 
162 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2865  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  24.09 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180044  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  24.84 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  24.66 
 
 
172 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.31 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13022  oxidoreductase  23.97 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.56 
 
 
166 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  24 
 
 
576 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  24.68 
 
 
582 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  27.54 
 
 
571 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  22.15 
 
 
166 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.39 
 
 
162 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  24.68 
 
 
582 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.31 
 
 
164 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4751  flavin reductase domain-containing protein  24.79 
 
 
168 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.527565  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  20.83 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  24.68 
 
 
591 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  21.53 
 
 
166 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  26.62 
 
 
589 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.81 
 
 
179 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  25.32 
 
 
591 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  26.06 
 
 
570 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.6 
 
 
183 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  22.38 
 
 
163 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1965  flavin reductase domain-containing protein  21.8 
 
 
167 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106654  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  22.38 
 
 
163 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0401  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.79 
 
 
162 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  27.59 
 
 
175 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  26.13 
 
 
320 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3418  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  21.49 
 
 
166 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.78 
 
 
157 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.03 
 
 
155 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>