More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1809 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.49 
 
 		 576 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  61.88 
 
 		 572 aa  765    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  53.39 
 
 		 591 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  62.52 
 
 		 576 aa  760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  61.1 
 
 		 579 aa  746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  66.03 
 
 		 574 aa  795    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  53.48 
 
 		 591 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  58.08 
 
 		 582 aa  716    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  57.9 
 
 		 582 aa  716    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  67.48 
 
 		 575 aa  806    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  53.66 
 
 		 591 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  100 
 
 		 571 aa  1184    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.67 
 
 		 576 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  67.48 
 
 		 575 aa  806    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  54.23 
 
 		 589 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  53.83 
 
 		 591 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  53.81 
 
 		 592 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  53.31 
 
 		 591 aa  664    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.65 
 
 		 575 aa  759    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  67.13 
 
 		 575 aa  810    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  66.49 
 
 		 582 aa  799    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  68.44 
 
 		 574 aa  809    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  57.99 
 
 		 591 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  66.26 
 
 		 575 aa  800    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  55.81 
 
 		 638 aa  650    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  44.62 
 
 		 570 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.89 
 
 		 573 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.72 
 
 		 573 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.78 
 
 		 573 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  41.34 
 
 		 574 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  41.86 
 
 		 569 aa  455  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  39.89 
 
 		 601 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.64 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  38.45 
 
 		 597 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  37.69 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  37.81 
 
 		 584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 		 576 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  35.24 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 571 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  33.04 
 
 		 598 aa  340  5e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 616 aa  336  9e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  32.82 
 
 		 613 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  33.8 
 
 		 597 aa  332  8e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  32.01 
 
 		 593 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 615 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  31.07 
 
 		 600 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  31.73 
 
 		 600 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  31.31 
 
 		 600 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  33.5 
 
 		 588 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  35.21 
 
 		 500 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  38.5 
 
 		 397 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  36.69 
 
 		 407 aa  262  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 425 aa  259  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 		 407 aa  257  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 407 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  35.42 
 
 		 407 aa  246  9e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  34.21 
 
 		 508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  34.45 
 
 		 399 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 399 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  35.11 
 
 		 884 aa  236  7e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 400 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 395 aa  223  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.62 
 
 		 878 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.62 
 
 		 878 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 395 aa  210  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 395 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.97 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.1 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  31.53 
 
 		 423 aa  191  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.17 
 
 		 505 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.69 
 
 		 498 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.17 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.17 
 
 		 494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.43 
 
 		 479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.43 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.43 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.43 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.91 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.61 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.91 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.91 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.91 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.91 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.91 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  28.91 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.91 
 
 		 479 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 396 aa  183  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 		 387 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.91 
 
 		 482 aa  183  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  33.55 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  30.71 
 
 		 409 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.17 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.17 
 
 		 503 aa  181  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.32 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>