More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4133 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4133  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 129 aa  258  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  54.46 
 
 		 196 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.92 
 
 		 168 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  52.08 
 
 		 174 aa  97.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.46 
 
 		 330 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  42.22 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  42.22 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  42.22 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  43.33 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  43.96 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  41.41 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  43.33 
 
 		 327 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.21 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  39.58 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  40.37 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.34 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.22 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  41.41 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  41.41 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  41.41 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 		 304 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  47.42 
 
 		 430 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.12 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.12 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  41.76 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  40 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  41.76 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.66 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  42.22 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  45.05 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  44.09 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.45 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  40.45 
 
 		 311 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  43.48 
 
 		 408 aa  73.9  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  37.07 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  38.64 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  40.43 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  40.43 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  41.28 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  41.76 
 
 		 180 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  38.61 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  42.22 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4310  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.99 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.11 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  38.61 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  33.91 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  43.48 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  41.49 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  44.44 
 
 		 346 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.39 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  42.7 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  36.29 
 
 		 204 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  45.74 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.7 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  43.33 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0399  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.312372 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  41.76 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.38 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  41.76 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  44 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  40.43 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  39.6 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.76 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  42.22 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  39.13 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  39.18 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  42.55 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  41.3 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.37 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.89 
 
 		 165 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.58 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.43 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  38.95 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  39.58 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1986  flavin reductase domain-containing protein  35.96 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  44.32 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  34.23 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  39.56 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  36.7 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.98 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>