235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  100 
 
 
303 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  78.2 
 
 
293 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  66.43 
 
 
288 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  69.26 
 
 
295 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  63.97 
 
 
299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  67.49 
 
 
287 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  66.2 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  66.2 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  66.2 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  65.61 
 
 
309 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  66.78 
 
 
287 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  64.66 
 
 
293 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  64.44 
 
 
291 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  63.73 
 
 
288 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  64.11 
 
 
294 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  64.66 
 
 
292 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  63.1 
 
 
291 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  66.55 
 
 
303 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  65.14 
 
 
290 aa  362  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  66.2 
 
 
328 aa  362  6e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  67.14 
 
 
290 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  62.37 
 
 
295 aa  358  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  61.27 
 
 
316 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  60.07 
 
 
313 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  58.62 
 
 
312 aa  348  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  60.69 
 
 
289 aa  345  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  62.5 
 
 
295 aa  344  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  62.81 
 
 
291 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  64.38 
 
 
298 aa  342  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  60.21 
 
 
359 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  61.03 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  56.57 
 
 
301 aa  325  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  59.11 
 
 
293 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  54.51 
 
 
303 aa  312  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  56.9 
 
 
301 aa  298  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  49.19 
 
 
330 aa  275  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  42.76 
 
 
297 aa  189  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  35.96 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.07 
 
 
323 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  42.41 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.09 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  36.33 
 
 
305 aa  158  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  35.76 
 
 
302 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  37.71 
 
 
286 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  36.48 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  36.82 
 
 
292 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  35.53 
 
 
307 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  36.15 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  34.92 
 
 
314 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  36.91 
 
 
308 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  37.59 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  36.21 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  35.92 
 
 
361 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  42.86 
 
 
299 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  35.14 
 
 
314 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.27 
 
 
268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.12 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.71 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.33 
 
 
309 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  34.67 
 
 
284 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  33.77 
 
 
277 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  36.05 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  33.56 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  33.67 
 
 
308 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.65 
 
 
283 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  33 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.99 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  33.33 
 
 
308 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  33.33 
 
 
308 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.75 
 
 
355 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  30.77 
 
 
265 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  35 
 
 
306 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.07 
 
 
311 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  37.65 
 
 
272 aa  99  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.77 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  34.21 
 
 
369 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  40.21 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.56 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  29.1 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  37.25 
 
 
274 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.74 
 
 
271 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.97 
 
 
484 aa  92.8  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  37.35 
 
 
268 aa  92.4  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  34.87 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  33.49 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  31.75 
 
 
463 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.45 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  31.25 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  34.48 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  36.54 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  33.12 
 
 
218 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  37.84 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30.04 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.13 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  32.18 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32.22 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  31.97 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  32.94 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.43 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  34.23 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>