258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0453 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  100 
 
 
238 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  36.45 
 
 
231 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.2 
 
 
274 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  35.48 
 
 
299 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  35.78 
 
 
271 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  35.84 
 
 
299 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  33.33 
 
 
361 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  32.56 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.65 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  32.66 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.27 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  33.33 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  33.67 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.16 
 
 
283 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  32.66 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  30.13 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  42.15 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  30.74 
 
 
276 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  33.6 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  31.78 
 
 
286 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  28.94 
 
 
288 aa  85.5  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  31.39 
 
 
271 aa  85.1  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  29.49 
 
 
277 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  35.1 
 
 
272 aa  85.1  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.47 
 
 
268 aa  82  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  33.8 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  31.05 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  35.51 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.64 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  30.8 
 
 
292 aa  79  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  27.57 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  29.8 
 
 
296 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  29.37 
 
 
308 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  29.43 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  28.87 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.64 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  30.35 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  35.82 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  27.78 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  31.38 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.79 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  27.85 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  29.65 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  27.84 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  29.75 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  27.64 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  23.61 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.65 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.65 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.96 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  29.66 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.95 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  28 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  27.14 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  27.14 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  31.09 
 
 
308 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  31.09 
 
 
308 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  31.09 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  32.37 
 
 
463 aa  72  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  28.51 
 
 
273 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  25.74 
 
 
359 aa  71.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  27.14 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  29.11 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  27.64 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  27.64 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  27.14 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  27.64 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  27.64 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  29.91 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  26.75 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  28.51 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  28 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  27.14 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  26.69 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  27.64 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.8 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  31.21 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  27.62 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  31.21 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  31.21 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  27.14 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  26.5 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  26.07 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  28.5 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  28.5 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  30.33 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  26.56 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  27.12 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  28.57 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.03 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  26.77 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  28.98 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  27.92 
 
 
312 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  27.14 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.43 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  27.87 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  28.17 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4210  LmbE family protein  34.59 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  27.49 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  29.65 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>