297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1195 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  38.16 
 
 		 227 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  33.48 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  36.84 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  35.8 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  39.79 
 
 		 237 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  39.27 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  39.27 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  37.56 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  35.65 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  38.02 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  34.91 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  33.48 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  34.91 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  37.83 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  38.36 
 
 		 244 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  33.76 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  35.1 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  36.2 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  33.33 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  39.58 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  40.62 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  34.06 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  41.84 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  38.14 
 
 		 236 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  33.33 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  36.91 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  42.75 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  33.68 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  31.74 
 
 		 242 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  32.64 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  32.47 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  31.17 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  31.69 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  32.5 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  31.25 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  38.66 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  33.86 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  41.13 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  34.8 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.05 
 
 		 236 aa  89.7  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  30.43 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  36.08 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  35.39 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  37.31 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  30.96 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  32.8 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  32.31 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  31.54 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  30.8 
 
 		 308 aa  85.9  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  33.01 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  31.75 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.15 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  39.01 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  38.33 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.82 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  37.06 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  30.54 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  33.86 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  33.33 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  28.26 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  36.17 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  30.99 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  32.7 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  30.53 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  30.16 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  31.61 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  35.83 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  33.83 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  33.14 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  29.1 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  30.08 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  36.36 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  33.86 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  36.14 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  31.05 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  36.36 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  33.1 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  37.04 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  29.87 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.82 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  33.66 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  36.36 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  38.74 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  33.67 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  28.57 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.96 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  38.73 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  31.09 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  29.61 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>