284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2445 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  34.07 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  35.94 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  34.18 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  30.7 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  30.04 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  33.16 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  37.14 
 
 		 260 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.72 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.43 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  29.66 
 
 		 259 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.86 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  31.16 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  31.05 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  32.42 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  32.42 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  32.42 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  31.58 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  32.42 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  32.42 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  32.42 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  29.23 
 
 		 292 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  32.42 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  32.42 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  32.42 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  28.7 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  30.11 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  31.87 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  33.01 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  28.44 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  29.24 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  32.42 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.23 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.54 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  30.43 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.98 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  29.25 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  31.79 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  29.15 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  30.54 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  30.69 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.24 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  27.64 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.41 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.61 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  33.51 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.38 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  30.56 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  28.63 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  29.95 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  29.61 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  33.47 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  25.85 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  27.75 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  28.11 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  25.76 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  28.11 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  28.34 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  26.81 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  28.8 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  25.59 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.59 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.59 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.59 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  36.43 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  29.95 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.59 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.99 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  28.42 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  33.05 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  28.37 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 		 492 aa  72  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  27.27 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.8 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  28.99 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  26.21 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  31.25 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  28.49 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.89 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  28.34 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  36.41 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  28.89 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  28.76 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  30.46 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  29 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  26.29 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.57 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  26.99 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  28.65 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  28.99 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  29.19 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  30.51 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  27.78 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  26.79 
 
 		 277 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  32.39 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  28.33 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  29.44 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  35.25 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  26.8 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>