192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0838 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  100 
 
 
254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  56.73 
 
 
213 aa  256  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  35.8 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  35.78 
 
 
250 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  32.14 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  31.08 
 
 
231 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.28 
 
 
239 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.67 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.67 
 
 
227 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.87 
 
 
239 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  29.49 
 
 
234 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.22 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  27.51 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.69 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.69 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  28.57 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  29.54 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  27 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  34.65 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.58 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  27.71 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  30.7 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  31.43 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.32 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  30.57 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  25.1 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  24.26 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  26.27 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  26.27 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.57 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  27.48 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  27.84 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.29 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.29 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  29.15 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  29 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  26.16 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  32.04 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  24.03 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  32.37 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  29.05 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  26.8 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.64 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  26.07 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  30.89 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  25 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  23.97 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  25 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.59 
 
 
298 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  28.14 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  26.67 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  24.14 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  24.46 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  23.79 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  29.79 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  25 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  23.48 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  24.87 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  26.36 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.7 
 
 
231 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  28.35 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.17 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.57 
 
 
217 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  29.17 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  28.32 
 
 
220 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  25.52 
 
 
238 aa  58.5  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  28.32 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  24.02 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  27.8 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  27.2 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  23.24 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  25.63 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  28.32 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.91 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  27.2 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.15 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  27.37 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  26.42 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  26.87 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  25.1 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  29.23 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  23.15 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  25.45 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  25.36 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.46 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  23.28 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  29.73 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  27.88 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  27.88 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  27.88 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  27.88 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  23.18 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.72 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  27.72 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.72 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>