188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2706 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  100 
 
 		 256 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  66.8 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  58.82 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  56.43 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  54.29 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  52.28 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  53.28 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  54.77 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  50.83 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  51.67 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  47.03 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  45.31 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  42.5 
 
 		 423 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  46.6 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  40.17 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  33.76 
 
 		 237 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  40.51 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  39.83 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  38.49 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  36.51 
 
 		 239 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  33.05 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  37.23 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  33.08 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  34.4 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  34.98 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  32.2 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  35.1 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  34.69 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  31.96 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.44 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.12 
 
 		 237 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  32.2 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  31.2 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  32.35 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.34 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.08 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  32.93 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.76 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  31.51 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  32.84 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  31.88 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  31.88 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  29.26 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  31.61 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  35.04 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  30.94 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  29.21 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  30.22 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.21 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  26.84 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  31.78 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  35.66 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.61 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  29.55 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  29.75 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  30.77 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.03 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  28.51 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  29.8 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.35 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  27.97 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  32.58 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  26.2 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.29 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.43 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  26.27 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  27.27 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  28.65 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  28.3 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  27.23 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  25.91 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  31.43 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  26.63 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  29.31 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  28.57 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  36.6 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  26.34 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  22.73 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.04 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  30.84 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  25.1 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.67 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  29.24 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  29.81 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  28.41 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  29.26 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  25 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  32.22 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  27.96 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  25.86 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  27.41 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  27.64 
 
 		 1071 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>