191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1056 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  100 
 
 		 239 aa  497  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  39.5 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  40 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  40.68 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  37.61 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  36.97 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  35.15 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  34.73 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  34.73 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  34.73 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  35.56 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  34.75 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  34.73 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  33.89 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  33.89 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  36.02 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  29.44 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  32.03 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  30.25 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.77 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  29.15 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  30.05 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  28.74 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.74 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.74 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.74 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.7 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.74 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.74 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  31.25 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.29 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.27 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  27.69 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.13 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  25.51 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  27.55 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  31.43 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  26.94 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  27.31 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  28.63 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  28.79 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  26.94 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.93 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  29.36 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  28.5 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.27 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.72 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.16 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  24.5 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.46 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.46 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  27.04 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.42 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  26.09 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  23.24 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  28.51 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  27.86 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  26.9 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.59 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.59 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.42 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  27.63 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  25.79 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  26.67 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  28.43 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  28.43 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  26.56 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  23.29 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  28.69 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  29.44 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  22.89 
 
 		 245 aa  62  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  28.15 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.19 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  30.77 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  25.83 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  27.09 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  30.46 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  28.06 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  33.33 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  28.06 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  27.41 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  27.32 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.59 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  25.94 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  27.98 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  26.73 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  24.69 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  24.14 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  27.43 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  26.22 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  27.36 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.54 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  26.5 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>