86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0330 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  100 
 
 		 246 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  80.91 
 
 		 245 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  80.08 
 
 		 247 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  85.71 
 
 		 244 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  85.29 
 
 		 258 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  80.08 
 
 		 245 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  80.08 
 
 		 245 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  85.29 
 
 		 244 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  80.08 
 
 		 245 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  83.88 
 
 		 245 aa  407  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  64.2 
 
 		 245 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  54.98 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  52.28 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  45.53 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  45.53 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  42.8 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  34.75 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  28.75 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  28.42 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  31.34 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  24.89 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  32.16 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  25.13 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  26.47 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  28.71 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  27.27 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  29.56 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  30.25 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.34 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  27.98 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  26.19 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.54 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.75 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  27.92 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  25.26 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.07 
 
 		 302 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.9 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.04 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  30.53 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  24.88 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  23.17 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  22.36 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 350 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  24.79 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.32 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  27.04 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  25.37 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  22.76 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  24.07 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  23.36 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  24.61 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  32.28 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  30.71 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  28.12 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  29.66 
 
 		 299 aa  45.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  27.42 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  24.75 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  24.74 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  25.36 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  26.13 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  26.05 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  32.61 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  24.3 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  26.13 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  24.77 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  24.26 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  28.78 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  26.13 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.23 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  26.26 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  22.4 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  26.71 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  26.56 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  22.33 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  21.14 
 
 		 234 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  21.83 
 
 		 298 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  29.38 
 
 		 236 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>