82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1395 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  52.44 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  35.45 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  33.1 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  39.72 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  33.11 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  32.88 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  30.25 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  30.25 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  26.56 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  32.1 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  28.38 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  29.7 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  35.88 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.5 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  35.77 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  29.76 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  31.03 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  33.59 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  31.03 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  30.15 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.27 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  31.41 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  30.77 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.38 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.91 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  31.06 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  31.06 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  31.06 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  30.38 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28.92 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  32.03 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  33.33 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  34.97 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  29.93 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  28.65 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  29.55 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  32.12 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  28.68 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.06 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  31.58 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  28 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  29.69 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.97 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  29.77 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  27.48 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  29.63 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  30.34 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.78 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  29.75 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  28.68 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  29.01 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  29.56 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  32.67 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  27.56 
 
 		 358 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  33.08 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  30.43 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.49 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.37 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  32.35 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  27.61 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  31.85 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.57 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.2 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  28.83 
 
 		 323 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  27.35 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.63 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  28.78 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  23.88 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  28.19 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  23.88 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  27.33 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  23.88 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  23.88 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  23.88 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  23.88 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  23.88 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  23.88 
 
 		 234 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  34.67 
 
 		 261 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  21.3 
 
 		 223 aa  42  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  27.82 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>