134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4022 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  57.2 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  56.78 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  47.86 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  45.19 
 
 		 245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  46.19 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  46.19 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  46.19 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  44.35 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  44.26 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  43.93 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  44.77 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  44.35 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  44.35 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  42.8 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  39.5 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  41.99 
 
 		 245 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  31.1 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.94 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  28.82 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.51 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  27.17 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  27.27 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  27.04 
 
 		 245 aa  62  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  27.32 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.66 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  27.04 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  28.45 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  25.63 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  32.56 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.6 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  26.15 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  25.48 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.23 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.89 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  28.44 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  26.8 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  29.02 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  23.81 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  25.3 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.35 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  26.63 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  26.22 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  27.27 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  27.67 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  29.44 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  30.22 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  26.77 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.89 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  25.13 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  26.26 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  25 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.9 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  30.22 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  31.65 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  30.71 
 
 		 313 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  30.77 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  22.89 
 
 		 350 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  24.69 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  27.98 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  28.78 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  27.34 
 
 		 303 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  25.71 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  23.5 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  25.52 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  24.5 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  26.81 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  28.06 
 
 		 309 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  23.73 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.73 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  24.23 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  23.96 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.46 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  26.98 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  26.29 
 
 		 359 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  27.46 
 
 		 290 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  28.99 
 
 		 293 aa  48.9  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  28.03 
 
 		 283 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  23 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  28.06 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  25.84 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  25.5 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  28.06 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  28.06 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  25.8 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  27.62 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  27.34 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.09 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  28.17 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  26.46 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  31.09 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  23.98 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  28.05 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>