110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2092 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  100 
 
 		 247 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  83.82 
 
 		 245 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  83.33 
 
 		 245 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  83.33 
 
 		 245 aa  434  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  83.33 
 
 		 245 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  84.02 
 
 		 245 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  83.68 
 
 		 258 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  83.75 
 
 		 244 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  83.68 
 
 		 244 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  80.08 
 
 		 246 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  65.84 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  56.54 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  53.23 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  47.28 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  44.35 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  44.81 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  36.97 
 
 		 239 aa  155  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  30.85 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.5 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  31.19 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  26.48 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.04 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.5 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  30.5 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  27.49 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  31.1 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.53 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  24.79 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  25.79 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  25.1 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  26.25 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  25.73 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.96 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  23.98 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  27.4 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  28.65 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  28.26 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  25.79 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.39 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  24.74 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  24.4 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  28.5 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.69 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.56 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.2 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25.2 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  28.72 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  29.37 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.37 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  23.76 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  27.46 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  27.31 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  30.41 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  27.73 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.61 
 
 		 288 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  27.92 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.54 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.13 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  31.13 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.41 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.87 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  23.35 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  26.5 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.64 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  26.79 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  29.5 
 
 		 288 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  26.4 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  24.58 
 
 		 308 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.84 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  27.5 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  29.71 
 
 		 303 aa  45.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  25.12 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  27.74 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  23.58 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  25.74 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.36 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.62 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.09 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  25.45 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  30.25 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  25 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  25.5 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  25.91 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  30.94 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  31.69 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  26.63 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  25.58 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  24.62 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  25.51 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  28.66 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  29.51 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  25.76 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  27.32 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  28.78 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>