227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1118 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  45.33 
 
 		 227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  52.42 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  44.59 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  46.4 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  45.29 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  42.79 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  40.97 
 
 		 569 aa  184  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  44.34 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  38.57 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  42.86 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  40.62 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  42.92 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  42.48 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  41.55 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  41.15 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  35.11 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  33.63 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  32.16 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  32.16 
 
 		 302 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  26.67 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  34.1 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  28.76 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  30.67 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  28.38 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  32 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.36 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  32.5 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  33.7 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  31.6 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.63 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  31.17 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  31.17 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  31.17 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.93 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  28.75 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  30.74 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  32 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  32 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  32 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  28.96 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.95 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  28.85 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.5 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  32.68 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  31 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  28.38 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  32.24 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  28.91 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.89 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  24.62 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  26.53 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.23 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  30.5 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  30.05 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  31.22 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  32.67 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  27.27 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  21.52 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.15 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.32 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.32 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  25.43 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  32.21 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  25.11 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  27.6 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  27.46 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  28.27 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.53 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  26.25 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  25.1 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  25.55 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.87 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.94 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  23.08 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  31.62 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  28.64 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  28.14 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  30.05 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  23.58 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  37.41 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.56 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.8 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  27.82 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  26.74 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  30 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  26.32 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  26.74 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  23.53 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  26.74 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  26.5 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  23.21 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  39.02 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  26.78 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  30.16 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  29.24 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  25.24 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  30.57 
 
 		 447 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>