96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2761 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  100 
 
 		 228 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  52.44 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  39.17 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.49 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  29.94 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  31.48 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.69 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  31.07 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  28.7 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  33.13 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.84 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  34.06 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  33.57 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  28.92 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  32.03 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  30.08 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28.12 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  28.3 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  27.23 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  28.12 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  32.8 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  33.82 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  35.07 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  35.66 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.37 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  33.9 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  35.16 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  27.71 
 
 		 350 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  35.07 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  24.48 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  32 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  33.33 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  31.5 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  27.27 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  30.61 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  29.75 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  29.77 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  25.77 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  26.61 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  26.09 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  30.77 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  28.26 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  27.91 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  34.38 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  28.26 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  28.48 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  32.09 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  26.62 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  26.26 
 
 		 277 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  26.62 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  29.71 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  26.62 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.36 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.46 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.83 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.86 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  32.52 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  26.81 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.73 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  29.55 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  32.26 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  28.36 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  31.3 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  28.47 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  26.48 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  31.36 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  29.12 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  27.52 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27.52 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27.52 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27.52 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.52 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  27.52 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27.52 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  26.81 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  30.83 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  31.9 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.52 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.83 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  29.2 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  27.5 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  30.71 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  25.84 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  28.23 
 
 		 464 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  29.84 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  26.85 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  28.1 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  25.11 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  27.91 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  33.02 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  27.01 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  33.62 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.85 
 
 		 218 aa  42  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  26.87 
 
 		 221 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  30.17 
 
 		 258 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>