119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4204 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  65.84 
 
 		 247 aa  345  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  65.83 
 
 		 245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  65.83 
 
 		 245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  65.83 
 
 		 245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  65.13 
 
 		 245 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  64.46 
 
 		 245 aa  316  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  63.71 
 
 		 258 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  64.2 
 
 		 246 aa  314  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  65.97 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  65.97 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  55.22 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  52.65 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  48.72 
 
 		 237 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  45.65 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  41.99 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  36.02 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  30.05 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.2 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.27 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.69 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.77 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  30.36 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  31.03 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.08 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  29 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  31.03 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.19 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  29.71 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.62 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.5 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  28.29 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  25 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.92 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  31.12 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  28.99 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  27.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  29.87 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  24.89 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.17 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.9 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  30.36 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  26.69 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  25.59 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.41 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  30.36 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.15 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.24 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  29.95 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.17 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  26.29 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.99 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  24.79 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  27.61 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  26.9 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 350 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  25.51 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  29.49 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.49 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  27.51 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  23.47 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  24.39 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  22.71 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  26.04 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  26.67 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  27.19 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  26.71 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  28.85 
 
 		 289 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  30.28 
 
 		 290 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  30.28 
 
 		 290 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  30.28 
 
 		 290 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  29.14 
 
 		 303 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  25.52 
 
 		 220 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  30.88 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  26.99 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  31.87 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  23.81 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  25.51 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.71 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  25.5 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  24.14 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  29.61 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  25 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  24.14 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  25.33 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  24.35 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  30.41 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  31.54 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>