178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1457 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  43.5 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  43.05 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  36.92 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  43.42 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  40.54 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  41.55 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  42.66 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  36.04 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  41.74 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  37.9 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  34.38 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  33.79 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  35.45 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  40.74 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  41.82 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  35.45 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  34.25 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  32.71 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  31.9 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  30.49 
 
 		 569 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  33.64 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  32.71 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  35.48 
 
 		 358 aa  91.7  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 350 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 359 aa  88.2  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  31.17 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  35.07 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  30.14 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  27.93 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.96 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.96 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  28.96 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.96 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.29 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.41 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.35 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  35.98 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.17 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  23.98 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.14 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  27.35 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  26.36 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  33.33 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  28.83 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  27.62 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  28.63 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  26.29 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  26.22 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  26.27 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  28.93 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  27.84 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.25 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  39.76 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  28.04 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  29.33 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  39.02 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  39.02 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.81 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  26.6 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.51 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  27.08 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  25.34 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  35.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  25.48 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  43.48 
 
 		 276 aa  52.4  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  37.21 
 
 		 462 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.53 
 
 		 304 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.71 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  39.56 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.53 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  36.59 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  27.01 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  26.32 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  25.74 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  26.47 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  26.36 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  41.11 
 
 		 693 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  32.31 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  29.17 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  33.04 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  29.17 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  25.78 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  24.22 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  28.09 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  38.75 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  28.72 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  38.82 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  32.18 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  28.75 
 
 		 302 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  28.5 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  35 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  27.62 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  32.73 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  32.23 
 
 		 447 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.67 
 
 		 492 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.7 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>