168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2062 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  100 
 
 		 288 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  53.97 
 
 		 264 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  42.29 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  39.47 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  39.62 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  28.36 
 
 		 469 aa  99  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  32.18 
 
 		 207 aa  92.4  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  28.43 
 
 		 693 aa  86.3  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  29.32 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  30.51 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  25.27 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  34.65 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  30 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  36.15 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  31.56 
 
 		 471 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  28.79 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  31.21 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  36.64 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  36.63 
 
 		 124 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  27.6 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  33.81 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  34.11 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  36.43 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  30.33 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  31.16 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  33.15 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  29.69 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  34.35 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  38.46 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  35.46 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  29.2 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.2 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.2 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  28.5 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  29.51 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  31.47 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  29.03 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  32.26 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  31.79 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  30.77 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  31.58 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  33.06 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  30.23 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  40 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  31.82 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.84 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.84 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.48 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  35.59 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.23 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  34.35 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  29.49 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.09 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  31.03 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  34.15 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  37.6 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  25 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  27.32 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  31.7 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  26.78 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  29.41 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  26.05 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  31.01 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  37.04 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  33.08 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  32.59 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  38.27 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  37.04 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  33.59 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  32.26 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  36.9 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  26.63 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  34.48 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  26.72 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  29.78 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  36.9 
 
 		 245 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.54 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  33.08 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  30.43 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  28.82 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  36.59 
 
 		 223 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  30.22 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>