135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0797 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  48.76 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  48.15 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  44.63 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  48.15 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  51.1 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  51.1 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  47.16 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  42.6 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  42.01 
 
 		 447 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  37.23 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  37.27 
 
 		 462 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  35.95 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  36.89 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  30.8 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.22 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  33.33 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  34.24 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  38.22 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  38.22 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  30.14 
 
 		 286 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  30.88 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  32.11 
 
 		 193 aa  89.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  31.3 
 
 		 502 aa  89.7  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  34.96 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  36.65 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  33.93 
 
 		 464 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  33.48 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  34.9 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  33.96 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  32.73 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  30.51 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  33.18 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  32.8 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  29.1 
 
 		 469 aa  72.4  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.78 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  35.81 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  27.1 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.65 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  26.46 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  36.79 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  35.1 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  21.76 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  32.12 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  37.93 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  43.01 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.02 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  31.03 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  30.27 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.68 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.66 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  36.26 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.39 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  38.27 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  38.27 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  25.76 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  29.41 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  29.27 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.23 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  26.42 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  38.95 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  35.63 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  29.95 
 
 		 316 aa  52  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.23 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  30.77 
 
 		 298 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  26.73 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  30.77 
 
 		 316 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  27.42 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  30 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.53 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.29 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  26.29 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  32.82 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  40.91 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  35.34 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.1 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  35.05 
 
 		 337 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  34.41 
 
 		 693 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  30.61 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  32.58 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  27.08 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  39.73 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  27.46 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.23 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.37 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  40.54 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1662  LmbE family protein  24.53 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197192  normal  0.810868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.74 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  35.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  20.42 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  24.42 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  25.74 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  25.74 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.79 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  32.81 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  26.56 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  35.37 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  29.67 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  55.26 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  28.8 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>