58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1017 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  100 
 
 		 316 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1075  LmbE family protein  88.76 
 
 		 258 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1078  LmbE family protein  86.86 
 
 		 258 aa  358  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0142184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  41.59 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2069  LmbE family protein  41.7 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.512905  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  35.71 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0441  LmbE family protein  40.08 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7836  LmbE family protein  37.24 
 
 		 273 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  38.52 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  28.37 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  33.11 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  29.71 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  24.46 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  33.98 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  30.77 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  35.03 
 
 		 427 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  28.94 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  26.26 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  34.47 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  25.87 
 
 		 693 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  31.25 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  32.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  28.4 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.85 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  30.99 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.8 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  23.56 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  30.72 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  32.68 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  31.79 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  25 
 
 		 227 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  29.73 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  30.65 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  34.34 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.13 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  34.03 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.56 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  31.71 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  23.58 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  30.32 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  32.68 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  33.56 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  34.09 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  32.88 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  29.41 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  27.86 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  28.75 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  35.2 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.9 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  26.38 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  29.32 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  26.24 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30.43 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  32.76 
 
 		 218 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  28.65 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  28.28 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  30.72 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  30.77 
 
 		 464 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>