171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3594 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  55.14 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  54.32 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  54.32 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  48.15 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  52.48 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  40.49 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  40.24 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  40.72 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  43.44 
 
 		 447 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  40.51 
 
 		 462 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  38.36 
 
 		 464 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  30.49 
 
 		 260 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  35.87 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  28.57 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  32.52 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  35.65 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  34.29 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  36.89 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  34.02 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  35.81 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  32.44 
 
 		 502 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  32.46 
 
 		 207 aa  87  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  33.06 
 
 		 471 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  30.13 
 
 		 286 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  31.97 
 
 		 464 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  35.19 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  35.19 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  31.82 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  33.03 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  33.2 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  27.2 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  34.72 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  30.18 
 
 		 193 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  30.4 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  34.23 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  32.12 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.15 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.64 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.64 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  35.11 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  37.06 
 
 		 708 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.59 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  26.42 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.43 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  24.49 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  39.53 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  32.52 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.91 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  24.62 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  26.4 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  24.55 
 
 		 693 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  36.56 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  24.31 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1370  LmbE-like protein  28.8 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.525647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  30.53 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  26 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  26 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  26 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  26 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  29.23 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  31.25 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  26.5 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  35.48 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.53 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.79 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  25.5 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  25.5 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  30.48 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.84 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  25.5 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  25.12 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  25.87 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  32.38 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  25.37 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  35.65 
 
 		 337 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  29.17 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.89 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  25.2 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  38.71 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  25.5 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  27.78 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  35.82 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  27.41 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  32.64 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  34.31 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  24.75 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  30.35 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.61 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  31.34 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.38 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  25.37 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  26.26 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  30.82 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  26.26 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  23.4 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  29.85 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  38.64 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  38.82 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>