123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_01090 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 
708 aa  1347    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  45.53 
 
 
464 aa  331  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  43.07 
 
 
471 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  40.43 
 
 
502 aa  280  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  40.22 
 
 
462 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  38.9 
 
 
464 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  37.14 
 
 
427 aa  163  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  35.12 
 
 
447 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  48.92 
 
 
208 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  47.28 
 
 
208 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  37.22 
 
 
277 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
250 aa  134  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  44.52 
 
 
199 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  43.4 
 
 
201 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  41.9 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  31.8 
 
 
265 aa  127  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  42.31 
 
 
197 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  41.51 
 
 
201 aa  126  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  43.21 
 
 
199 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  43.87 
 
 
199 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  37.1 
 
 
203 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  43.87 
 
 
199 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  40.49 
 
 
195 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  41.36 
 
 
199 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  39.78 
 
 
199 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  39.34 
 
 
192 aa  119  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
219 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  36.99 
 
 
255 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  39.88 
 
 
202 aa  108  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  37.84 
 
 
198 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
219 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  38.99 
 
 
192 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  37.84 
 
 
198 aa  107  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  39.26 
 
 
240 aa  107  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
273 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  35.14 
 
 
197 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
223 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
234 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
232 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  34.98 
 
 
257 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  35.23 
 
 
257 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  35.94 
 
 
260 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.79 
 
 
217 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  41.03 
 
 
261 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  38.22 
 
 
207 aa  97.4  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
247 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
227 aa  95.1  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  28.4 
 
 
286 aa  94.7  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  39.47 
 
 
197 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  33.93 
 
 
252 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  35.63 
 
 
255 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  31.76 
 
 
252 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  36.89 
 
 
251 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
217 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  36.44 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  39.88 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
270 aa  84  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  36 
 
 
251 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
224 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  34.62 
 
 
192 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  37.93 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  33.48 
 
 
250 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
217 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
218 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  35.53 
 
 
246 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  30.42 
 
 
253 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  36.17 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  33.05 
 
 
246 aa  70.5  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  35.24 
 
 
245 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  27.94 
 
 
292 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  31.48 
 
 
235 aa  66.6  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
270 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  34.43 
 
 
245 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  30.46 
 
 
207 aa  64.7  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
227 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  29.39 
 
 
264 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
364 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  33.83 
 
 
245 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
362 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
390 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
372 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  32.89 
 
 
244 aa  58.9  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
362 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  30.14 
 
 
288 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  23.97 
 
 
260 aa  54.7  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.12 
 
 
265 aa  54.3  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  29.01 
 
 
300 aa  54.7  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
1001 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  33.93 
 
 
487 aa  54.3  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
277 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  30.71 
 
 
193 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  38.36 
 
 
124 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  30.4 
 
 
245 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  34 
 
 
299 aa  51.6  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  31.33 
 
 
265 aa  51.6  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  29.03 
 
 
264 aa  50.8  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  32.19 
 
 
271 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>