287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1295 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  100 
 
 
241 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  48.73 
 
 
234 aa  204  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  46.52 
 
 
237 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  50.43 
 
 
244 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  47.01 
 
 
243 aa  185  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  50.22 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  43.7 
 
 
244 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  44.12 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  41.74 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  41.15 
 
 
239 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  44.26 
 
 
242 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  41.59 
 
 
240 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  40.59 
 
 
227 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  37.71 
 
 
231 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  39.41 
 
 
259 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  38.91 
 
 
227 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  37.34 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  36.93 
 
 
237 aa  144  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  37.08 
 
 
237 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  38.14 
 
 
258 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  41.67 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  36.25 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  35.19 
 
 
245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  37.28 
 
 
239 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  32.62 
 
 
242 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  36.82 
 
 
240 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  32.5 
 
 
256 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  35.29 
 
 
241 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  32.62 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  33.47 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  31.85 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  34.8 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  33.19 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.82 
 
 
276 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  32.24 
 
 
236 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  36.55 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  30.54 
 
 
234 aa  85.1  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  29.71 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  30.21 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  30.21 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  29.29 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  29.29 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  29.29 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  29.29 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  29.29 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  29.79 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  27.94 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.94 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  34.55 
 
 
299 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.72 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  26.69 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.58 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  31 
 
 
423 aa  75.5  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  31.38 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.77 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  26.69 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.56 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.33 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  34.98 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  30.25 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.96 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  33.79 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  34.15 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.96 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  32.7 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  28.46 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.95 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  28.63 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.96 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  26.64 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  33.05 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.35 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  32.23 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  27.39 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  29.05 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  33.77 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.39 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.91 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  31.78 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  29.79 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  30.08 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.5 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.31 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30.39 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  28.63 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  31.96 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  25 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  30.9 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  31.78 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  33.5 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  36.36 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.37 
 
 
298 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  26.27 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  31.45 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  30.96 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  27.2 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  36.48 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  29.21 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  33.33 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>