75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0312 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  100 
 
 		 487 aa  1010    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  31.52 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  29.78 
 
 		 693 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  36.27 
 
 		 337 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  32.89 
 
 		 300 aa  156  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  34.42 
 
 		 316 aa  150  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  32.72 
 
 		 322 aa  136  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  56.73 
 
 		 124 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  27.8 
 
 		 277 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  28.53 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  28 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  27.01 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  26.87 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  25.27 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  27.51 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.99 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  26.18 
 
 		 302 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  36.36 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  36.36 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  25.37 
 
 		 264 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  22.35 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  35.35 
 
 		 245 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.34 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  36.56 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.74 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  27.17 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  23.51 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  36.26 
 
 		 244 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  36.96 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  21.81 
 
 		 292 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  33.93 
 
 		 708 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  33.71 
 
 		 261 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.14 
 
 		 234 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  24.63 
 
 		 225 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.14 
 
 		 234 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  24.43 
 
 		 234 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  31.43 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  21.29 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.18 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  22.09 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  31.25 
 
 		 193 aa  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  25.7 
 
 		 316 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  39.13 
 
 		 237 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4990  LmbE family protein  22.56 
 
 		 467 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  35.87 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  23.74 
 
 		 236 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  21.71 
 
 		 476 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.61 
 
 		 237 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  20.88 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  22.05 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  29.59 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  24.24 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  27.84 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  29.59 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  26.44 
 
 		 221 aa  44.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  22.18 
 
 		 270 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  23.88 
 
 		 213 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  34.04 
 
 		 295 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.34 
 
 		 231 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  26.63 
 
 		 311 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.68 
 
 		 217 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  27.91 
 
 		 281 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  30 
 
 		 244 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  34.38 
 
 		 243 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  28.44 
 
 		 272 aa  43.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>