130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1264 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  100 
 
 		 322 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  58.17 
 
 		 316 aa  301  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  56.72 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  37.73 
 
 		 469 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  37.72 
 
 		 693 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  32.72 
 
 		 487 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  31.29 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  30.6 
 
 		 265 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  30.71 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  29.89 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  29.6 
 
 		 264 aa  89.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  42 
 
 		 124 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  24.63 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  31.82 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  24.14 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  27.6 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  29.17 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  42.27 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  30.72 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  25.77 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  25.71 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  28.63 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  26.07 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.77 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  34.08 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  30.92 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  30.37 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  28.31 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  43.01 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  29.26 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.91 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  36.94 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  28.41 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  24.6 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  32.46 
 
 		 193 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  36.46 
 
 		 245 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  36.94 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  40.86 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  29.71 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  21.77 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  28.4 
 
 		 471 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.84 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  28.32 
 
 		 464 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  29.63 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  35.86 
 
 		 462 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  30.77 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  38.71 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  38.24 
 
 		 260 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4989  hypothetical protein  30.6 
 
 		 478 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  22.14 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  29.32 
 
 		 240 aa  52.8  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  27.31 
 
 		 252 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  29.26 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  29.26 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.7 
 
 		 237 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.41 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  37.08 
 
 		 261 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.13 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  27.86 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  27.67 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  35.2 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.27 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  33.33 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  26.1 
 
 		 242 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0531  LmbE-like protein  31.98 
 
 		 469 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  28.9 
 
 		 476 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  26.88 
 
 		 226 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  26.88 
 
 		 226 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  30.48 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  27.73 
 
 		 246 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  29.14 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  28.8 
 
 		 467 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.12 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.77 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  24.08 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.19 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  26.55 
 
 		 502 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  24.05 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  35.51 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  27.02 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  33.6 
 
 		 237 aa  47  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  29.21 
 
 		 244 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  36.08 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.84 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  32.26 
 
 		 222 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  27.07 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  28.73 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.43 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  29.19 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  25.6 
 
 		 244 aa  46.2  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  28.06 
 
 		 292 aa  45.8  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  36.56 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  50 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  25.1 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  31.58 
 
 		 487 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00580  N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol deacetylase, putative  24.83 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5737  hypothetical protein  31.58 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  36.54 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 472 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>