17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00580 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00580  N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol deacetylase, putative  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30247  N-acetylglucosaminyl phosphatidylinositol de-N-acetylase  29.88 
 
 
312 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0132801  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34729  predicted protein  30.68 
 
 
275 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00049  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12550)  26.67 
 
 
312 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143318  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34610  n-acetylglucosaminyl phosphatidylinositol deacetylase  30.92 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  28.75 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  28.93 
 
 
223 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  24.66 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.57 
 
 
238 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.22 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  27.45 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  25 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  27.01 
 
 
264 aa  49.3  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  28.24 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  28.92 
 
 
264 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.16 
 
 
250 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  26.23 
 
 
322 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>