167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1286 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  53.97 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  46.33 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  47.13 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  43.68 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  27.01 
 
 		 487 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  27.85 
 
 		 469 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  28.72 
 
 		 337 aa  98.6  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  29.96 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  28.67 
 
 		 693 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  29.6 
 
 		 322 aa  88.6  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  28.06 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  30.82 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  36.43 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.96 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  28.63 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  27.48 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  33.33 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  31.88 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  32.37 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  32.59 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  34.65 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  31.69 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  31.94 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.2 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  28.74 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  31.11 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.44 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  28.66 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  26.41 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1116  hypothetical protein  23.1 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.364515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  30.22 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  23.79 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  35.83 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.6 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  31.34 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  32.06 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  30 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  27.27 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.23 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  32.54 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  31.97 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  30.47 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  25.74 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.85 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  24.89 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.85 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  28.57 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.32 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  28.47 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.54 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  34.55 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.32 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  34.52 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.12 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.78 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  29.58 
 
 		 464 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.42 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  34.65 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.42 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  30.17 
 
 		 207 aa  52.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  23.68 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  32.54 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.37 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  29.51 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  25.24 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  32.59 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  26.29 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.03 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  31.11 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  31.11 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  33.33 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  31.11 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  31.62 
 
 		 203 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  26.7 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  24.3 
 
 		 502 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00580  N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol deacetylase, putative  27.01 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  28.57 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.25 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  25.43 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  35.37 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.73 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2412  LmbE family protein  28.8 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  34.15 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  30.61 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  32.2 
 
 		 427 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  32.56 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.91 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  27.03 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.19 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>