95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0835 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  100 
 
 		 209 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  43.48 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  41.55 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  30.92 
 
 		 302 aa  99  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  30.29 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  28.43 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  30.59 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  26.34 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  27.83 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  25.94 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  26.18 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  26.73 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  28.3 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  28.3 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  30.05 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  25.47 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  25.71 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  24.88 
 
 		 350 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  23.71 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  26.73 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.4 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  23.47 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  26.94 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  26.32 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.94 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.94 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  26.94 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  26.11 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.68 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  25.76 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  24.55 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.89 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  24.64 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.69 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  24.74 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  23.85 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  26.67 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  28.03 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  22.97 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  32.69 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  23.58 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  31.97 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  26.29 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  24.43 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.51 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.89 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  23.3 
 
 		 359 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  24.87 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  26.64 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  26.52 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.43 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.43 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.43 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  23.71 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.43 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.43 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  23.42 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  24.89 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  23.94 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  23.71 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  23.18 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  31.03 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  22.71 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  24.22 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  24.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  23.18 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  25.95 
 
 		 302 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  26.53 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  24.23 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  28.89 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  23.63 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25.65 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  20.66 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  24.58 
 
 		 288 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  23.08 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  23.87 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  28.46 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30.47 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  27.21 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  23.53 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.41 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  23.18 
 
 		 447 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.81 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  30.7 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  30.3 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.8 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  22.03 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.81 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  25.34 
 
 		 277 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  27.27 
 
 		 238 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  23.4 
 
 		 243 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.85 
 
 		 237 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  23.98 
 
 		 316 aa  41.2  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>