158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3264 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  99.55 
 
 		 223 aa  463  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  100 
 
 		 223 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  100 
 
 		 223 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  100 
 
 		 223 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  99.1 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  39.22 
 
 		 308 aa  138  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  35.58 
 
 		 302 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 359 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 358 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 350 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  34.15 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  33.18 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  28.89 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  31.03 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  29.96 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  30.58 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  29.91 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  31.6 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  29.18 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  29.25 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  30.49 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  31.67 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  28.63 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  25.44 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  31.17 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  27.27 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.59 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  28.35 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  27.54 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  28.96 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  26.58 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  25.97 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  26.39 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  28.33 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  32.89 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  27.03 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.19 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  30.53 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  26.87 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  26.94 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  31.22 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  30.84 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  28.84 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  26.64 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  28.17 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  26.84 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.69 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.65 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  25.96 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.92 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  26.03 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  27.47 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  26.67 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  28.32 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.73 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.48 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.35 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.11 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  26.81 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  25.44 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.65 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  42.47 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.73 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  28.63 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  27.6 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  38.6 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  27.39 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.07 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  26.79 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  35.38 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  30.61 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  27.84 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  25.47 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  25.47 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  29.37 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.41 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  29.12 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  30.51 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  35.96 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  25.97 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  27.72 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  27.97 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  30.92 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  25.65 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  29.45 
 
 		 265 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  29.85 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  24.69 
 
 		 569 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  26.78 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  35.9 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  26.61 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  25.48 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  25.94 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>