195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1419 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  517  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  65.31 
 
 
249 aa  347  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  66.12 
 
 
245 aa  343  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  64.37 
 
 
247 aa  334  7.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  63.52 
 
 
250 aa  332  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  62.7 
 
 
245 aa  325  6e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  61.16 
 
 
270 aa  319  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  45.54 
 
 
239 aa  205  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  42.61 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  41.74 
 
 
238 aa  198  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  40.43 
 
 
238 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  42.48 
 
 
243 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  42.8 
 
 
242 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  40.43 
 
 
243 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  41.1 
 
 
238 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  41.63 
 
 
266 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  37.55 
 
 
242 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  37.28 
 
 
236 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  39.38 
 
 
236 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  33.62 
 
 
237 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  33.63 
 
 
234 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  33.63 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  33.19 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  33.19 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  32.3 
 
 
234 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  35.42 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  37.22 
 
 
225 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  34.68 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  32 
 
 
248 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  31.02 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  28.98 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  30.17 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  28.81 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  31.02 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  31.78 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.23 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.26 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  28.44 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  27.71 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  25 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  27.51 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  29.22 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  29.06 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  28.65 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  27.64 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.85 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  24.32 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.1 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  27.23 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  25.71 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  31.61 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.85 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.85 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  29.85 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.85 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.85 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  36.94 
 
 
350 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  33.9 
 
 
308 aa  62  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.32 
 
 
280 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  25.52 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  28.64 
 
 
290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  28.64 
 
 
290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  28.64 
 
 
290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  31.5 
 
 
358 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.18 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  33.58 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  24.53 
 
 
302 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  26.24 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  27.62 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  26.79 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  30.83 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  34.33 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  27.11 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.09 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  27.66 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  29.05 
 
 
293 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.34 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  27.53 
 
 
294 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  28.79 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  28.71 
 
 
299 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  33.58 
 
 
193 aa  55.1  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  29.65 
 
 
290 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  30.05 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.66 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  24.72 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.79 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.78 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.3 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  33.53 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  38 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  28.04 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  26.44 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>