More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1269 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  100 
 
 
359 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  61.74 
 
 
358 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  55.33 
 
 
358 aa  352  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  47.24 
 
 
350 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  42.79 
 
 
308 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  37.44 
 
 
302 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  44.95 
 
 
233 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  38.35 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.94 
 
 
223 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.94 
 
 
223 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.94 
 
 
223 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  35.94 
 
 
223 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  35.42 
 
 
223 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  31.53 
 
 
227 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  31.08 
 
 
225 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  33.33 
 
 
203 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  31.11 
 
 
225 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  32.78 
 
 
223 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  33.98 
 
 
227 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.04 
 
 
466 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  35.09 
 
 
209 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
1383 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.51 
 
 
220 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  30.24 
 
 
225 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  31.78 
 
 
210 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29000  sigma54-dependent response regulator, two-component  46.73 
 
 
472 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.99042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.5 
 
 
1514 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.5 
 
 
1514 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50180  two-component response regulator  46.02 
 
 
473 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2343  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.26 
 
 
475 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4272  two-component response regulator  46.02 
 
 
470 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4999  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  43.75 
 
 
523 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3419  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.44 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0592604  normal  0.514799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  32.04 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
1390 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
1390 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
1390 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
1287 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1874  two component signal response regulator LuxO  40 
 
 
469 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0317984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
1431 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 
544 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2321  nitrogen regulation protein NR(I)  35.56 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 
534 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  39.6 
 
 
468 aa  82.8  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02891  flagellar regulatory protein C  42.24 
 
 
445 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2018  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3049  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.24 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
567 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2788  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.98 
 
 
474 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  39.6 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1999  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.66 
 
 
481 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.06 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
121 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  40.15 
 
 
1202 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0710  response regulator receiver domain-containing protein  31.65 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
119 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.12 
 
 
462 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.87 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.750458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1726  hypothetical protein  38.79 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  30.56 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.62 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0541  LuxO repressor protein  35.66 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  34.38 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1726  hypothetical protein  38.79 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2500  two component Fis family transcriptional regulator  39.1 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  39.06 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.08 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45900  nitrogen regulation protein, sigma 54-dependent response regulator NtrC (NR(I))  34.27 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  38.64 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  38.64 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  39.06 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  38.64 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67680  two-component response regulator NtrC  34.83 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000437551  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  38.64 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  38.64 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1378  response regulator receiver domain-containing protein  32.61 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321431  normal  0.0110306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0077  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.4 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2521  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.62 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0633509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  40.87 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.16 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  34.29 
 
 
467 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.23 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5048  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  38.89 
 
 
478 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42 
 
 
480 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.21 
 
 
471 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2984  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.55 
 
 
458 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.826768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
119 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  38.28 
 
 
470 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0246  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  39.53 
 
 
469 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.487777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
1370 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4505  transcriptional regulatory protein ZraR  37.61 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5101  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  38.89 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5859  two-component response regulator NtrC  34.27 
 
 
476 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>