164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02910 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  100 
 
 		 225 aa  471  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  46.43 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  40.62 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  41.96 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  39.37 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  36.36 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  37.1 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  38.46 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  37.05 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  36.99 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  33.79 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  35.56 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  33.33 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  32.74 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  34.8 
 
 		 569 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  33.79 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  30.32 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  29.86 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  29.39 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  28.27 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 359 aa  95.1  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  28.02 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.95 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  27.35 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  85.5  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  28.7 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 350 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  33.51 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  32.74 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  29.61 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  32.29 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  31.84 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  30.4 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  31.84 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  31.84 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  31.84 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  31.84 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  31.84 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  31.84 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  31.39 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.82 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  28.25 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  26.94 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.62 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.87 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  28.46 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  30.38 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  27.03 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.02 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  27.94 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.69 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  23.11 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  27.07 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.13 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.19 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  25.53 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.34 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  24.32 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  24.55 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  27.35 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.06 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.06 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.84 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.12 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  26.98 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  25.1 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  29.63 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.93 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.53 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.91 
 
 		 492 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  28.65 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  27.59 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.63 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  27.78 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.06 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  29.1 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  24.59 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  29.1 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  24.69 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  27.13 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  25 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  27.51 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  24.14 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  25.3 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  29.41 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  27.39 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  25.58 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  26.55 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  26.18 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  23.74 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  23.81 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>