216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5673 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  93.33 
 
 
225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  48.18 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  52 
 
 
227 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  45.95 
 
 
227 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  44.59 
 
 
225 aa  198  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  42.99 
 
 
223 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  43.24 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  42.73 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  40.36 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  43.5 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  41.26 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  39.91 
 
 
569 aa  168  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  40.09 
 
 
218 aa  168  8e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  38.46 
 
 
225 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  38.33 
 
 
225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  38.18 
 
 
228 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  37.05 
 
 
230 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  38.57 
 
 
225 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  31.42 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.96 
 
 
302 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  27.47 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
359 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  28.9 
 
 
265 aa  88.6  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.9 
 
 
277 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.23 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  28.15 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  29.82 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  27.93 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  28.12 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  29.28 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  31.39 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  27.51 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  27.98 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  24 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.35 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.35 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.35 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  28.35 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.35 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.03 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  31.18 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  28.19 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.53 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.5 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.98 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  27.32 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  28.82 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  26.18 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.46 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  25.11 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.26 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  26.96 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  33.09 
 
 
265 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  29.26 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.42 
 
 
234 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.42 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  28.29 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  28.72 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  25.52 
 
 
238 aa  61.6  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25.91 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  28.72 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  25.66 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  30.66 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  24.74 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  24.23 
 
 
276 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  28.45 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.23 
 
 
270 aa  59.3  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  29.74 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  24.51 
 
 
239 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.78 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  27.94 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.23 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  25.22 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.23 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  25.54 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  27.66 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  27.66 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  26 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  25.91 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  26.75 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  25.97 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  30.53 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  25.97 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  31.58 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  27.8 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  23.32 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  26.82 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>