188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2173 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  43.24 
 
 		 225 aa  197  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  42.79 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  45.95 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  41.36 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  44 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  43.69 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  39.29 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  42.08 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  38.46 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  39.21 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  38.91 
 
 		 569 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  35.56 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  38.94 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  35.84 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  35.91 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  33.03 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  32.61 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  29.2 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  26.63 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.05 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 350 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  29.13 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  29.02 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 359 aa  75.1  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  25.68 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  26.38 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  27.35 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  27.73 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  27.07 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  32.8 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  26.82 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  30.36 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  29.47 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  27.73 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.21 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.26 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.21 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.44 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  23.91 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  23.91 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  23.91 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  23.91 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  23.91 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  23.91 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  23.91 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.52 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  26.11 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.78 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  26.5 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  23.48 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  23.91 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  28.93 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  39.47 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  26.76 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  27.47 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.7 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  25.97 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  28.43 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  30 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  23.77 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  24.27 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  29.72 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  33.33 
 
 		 464 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  24.89 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  24.23 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  29.5 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  28.96 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  21.97 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  25.42 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  28.64 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  27.23 
 
 		 298 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.55 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  36 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  25.42 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  25.93 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2558  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.86 
 
 		 492 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  25 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  24.87 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.55 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  25.55 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.55 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  25.99 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  22.46 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  27.34 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  27.91 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  25.85 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  23.28 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  25.75 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  25.65 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  27.32 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  29.11 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  24.89 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  25.38 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  30.91 
 
 		 302 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  25.52 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.72 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  31.58 
 
 		 316 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.92 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>