176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0511 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  100 
 
 		 464 aa  895    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  45.49 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  43.54 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  43.65 
 
 		 462 aa  299  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  41.59 
 
 		 464 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  38.76 
 
 		 708 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  36.56 
 
 		 447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  36.55 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  49.24 
 
 		 208 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  49.24 
 
 		 208 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  49.01 
 
 		 201 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  48.51 
 
 		 201 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  45.5 
 
 		 199 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  45.05 
 
 		 203 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  43.81 
 
 		 195 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  44.44 
 
 		 199 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  37.39 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  42.13 
 
 		 277 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  43.2 
 
 		 199 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  45.88 
 
 		 191 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  42.93 
 
 		 199 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  42.93 
 
 		 199 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  43.19 
 
 		 240 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  40.91 
 
 		 199 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  44.5 
 
 		 198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  43.5 
 
 		 198 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  42.06 
 
 		 260 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  39.81 
 
 		 252 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  44.12 
 
 		 207 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  39.3 
 
 		 255 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  42.47 
 
 		 192 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  38.22 
 
 		 252 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 197 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  42.94 
 
 		 192 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  40.89 
 
 		 251 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  36.22 
 
 		 257 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  36.65 
 
 		 257 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  36.65 
 
 		 251 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  36.65 
 
 		 251 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  36.41 
 
 		 197 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  35.86 
 
 		 250 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  42.14 
 
 		 192 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  31.02 
 
 		 286 aa  107  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  44.55 
 
 		 197 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  38.02 
 
 		 202 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  37.61 
 
 		 235 aa  98.2  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  34.22 
 
 		 253 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  31.3 
 
 		 264 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  32.73 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  37.33 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  34.09 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  33.67 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  31.97 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  34.18 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  36.41 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  35.19 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  36.09 
 
 		 209 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  38.67 
 
 		 302 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  26.67 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  36.88 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  46.46 
 
 		 234 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0905  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 		 1001 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  24.03 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  24.89 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  26.41 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 1015 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  35.11 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  32.32 
 
 		 6999 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 		 222 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  34.35 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  37.14 
 
 		 693 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  32.35 
 
 		 207 aa  54.3  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.82 
 
 		 237 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  27.97 
 
 		 277 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.81 
 
 		 7541 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  29.71 
 
 		 265 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  24.04 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  40.21 
 
 		 8211 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  28.97 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  32.58 
 
 		 231 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.06 
 
 		 237 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.06 
 
 		 237 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  31.58 
 
 		 250 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  40 
 
 		 244 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.98 
 
 		 3639 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  37.36 
 
 		 254 aa  50.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.04 
 
 		 271 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  24.48 
 
 		 469 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  32.54 
 
 		 207 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  31.43 
 
 		 487 aa  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  36.89 
 
 		 281 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  27.27 
 
 		 193 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.72 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  39.1 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 210 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.18 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>