101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0957 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  100 
 
 		 190 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  81.48 
 
 		 189 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  81.48 
 
 		 189 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  38.79 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  33.86 
 
 		 471 aa  67.8  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  37.93 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  38.14 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  37.07 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  32.5 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  39.66 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  41.18 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  36.27 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  35.9 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  31.14 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  38.89 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  37.5 
 
 		 464 aa  57.8  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  37.04 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.87 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  36.36 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  36.44 
 
 		 502 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  32.03 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  35.29 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  32.98 
 
 		 4483 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.45 
 
 		 255 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  33.02 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  29.2 
 
 		 464 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.63 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  35.56 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  40.48 
 
 		 2012 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  46.05 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  33.61 
 
 		 364 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 		 6999 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 257 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  36.07 
 
 		 2997 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.53 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  33.62 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  42.68 
 
 		 1140 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0720096  normal  0.188853 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.53 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.41 
 
 		 257 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 255 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 265 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  28.18 
 
 		 311 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  34.55 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  34 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1672  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  29.73 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  35.53 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 300 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.46 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  37.76 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  37.65 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.8 
 
 		 7541 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  33.7 
 
 		 1914 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.56 
 
 		 300 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1473  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.05 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.103865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  39.02 
 
 		 8211 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  30.58 
 
 		 258 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0768  methyltransferase type 12  29.27 
 
 		 222 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 		 251 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.05 
 
 		 298 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.67 
 
 		 293 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.96 
 
 		 264 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.05 
 
 		 298 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.44 
 
 		 300 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  35.9 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.85 
 
 		 302 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  37.18 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.7 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.93 
 
 		 295 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  27.91 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.09 
 
 		 256 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.44 
 
 		 300 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.44 
 
 		 300 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 236 aa  41.2  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.71 
 
 		 254 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>