55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5417 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  55.5 
 
 		 201 aa  228  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  55.5 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  53.06 
 
 		 208 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  53.06 
 
 		 208 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  50 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  47.31 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  45.83 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  45.45 
 
 		 462 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  46.24 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  45.99 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  46.2 
 
 		 464 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  44.5 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  43.16 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  40.93 
 
 		 502 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  44.72 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  41.18 
 
 		 464 aa  143  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  42.37 
 
 		 471 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  35.84 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  39.47 
 
 		 195 aa  138  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  47.22 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  37.3 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  40.44 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  43.97 
 
 		 192 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  35.5 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  38.25 
 
 		 427 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  39.66 
 
 		 708 aa  114  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  38.55 
 
 		 447 aa  107  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  40.65 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  43.06 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  31.34 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 1015 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  28.23 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 		 1001 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  35.85 
 
 		 264 aa  52.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  33.02 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.93 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  25.76 
 
 		 2012 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 318 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  32.08 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 331 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.27 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 309 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 309 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 331 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.73 
 
 		 249 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 249 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>