193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3896 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 175 aa  362  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  30.6 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  29.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  23.81 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  44.12 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  28.26 
 
 		 471 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 251 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  25.17 
 
 		 427 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  36.46 
 
 		 361 aa  51.6  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  33.62 
 
 		 269 aa  51.2  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  24.07 
 
 		 258 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 356 aa  50.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.59 
 
 		 246 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  26.54 
 
 		 502 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 244 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 262 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 265 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  24.82 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.5 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.53 
 
 		 395 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 263 aa  48.5  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 263 aa  48.5  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 263 aa  48.5  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 365 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  26.36 
 
 		 243 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 240 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  26.43 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 403 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  27.46 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  25 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.09 
 
 		 296 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.4 
 
 		 258 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.63 
 
 		 258 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  32.95 
 
 		 399 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  26.36 
 
 		 447 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.19 
 
 		 242 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  33.03 
 
 		 400 aa  45.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 264 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  33.98 
 
 		 282 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  25.4 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  24.29 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 273 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.4 
 
 		 258 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 263 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 240 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  31.13 
 
 		 407 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.33 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0499  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.54 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 317 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 		 325 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  26.05 
 
 		 248 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  29.25 
 
 		 273 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  23.68 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 236 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 196 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  30 
 
 		 257 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  34.09 
 
 		 400 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  29.27 
 
 		 246 aa  44.7  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 268 aa  44.7  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32.41 
 
 		 263 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.5 
 
 		 304 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.78 
 
 		 262 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 247 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 225 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 273 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  27.78 
 
 		 261 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 270 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3415  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 257 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 		 541 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 415 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  27.21 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  28.92 
 
 		 399 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.78 
 
 		 261 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 		 541 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 487 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  33.73 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  31.25 
 
 		 541 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.8 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 390 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 		 541 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>