57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2239 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  93.03 
 
 		 201 aa  380  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  55.5 
 
 		 199 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  54.04 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  52.53 
 
 		 208 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  51.5 
 
 		 199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  46.91 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  49.25 
 
 		 462 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  47.87 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  46.81 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  47.34 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  43.72 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  47 
 
 		 240 aa  160  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  47.03 
 
 		 464 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  39.01 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  41.84 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  45.81 
 
 		 464 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  45.41 
 
 		 502 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  41.34 
 
 		 471 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  39.8 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  40.3 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  41.27 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  42.78 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  43.59 
 
 		 708 aa  122  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  43.66 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  41.49 
 
 		 427 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  37.57 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  38.12 
 
 		 447 aa  104  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  36.7 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  40.97 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  39.58 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  38.19 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 1015 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  29.63 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 		 1001 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  33.33 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2709  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.1 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 318 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  26.97 
 
 		 2012 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 277 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  31.48 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  24.27 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.7 
 
 		 7541 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  27.66 
 
 		 492 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  29.35 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.4 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>