70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2654 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  83.42 
 
 		 199 aa  349  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  83.42 
 
 		 199 aa  349  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  80.9 
 
 		 199 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  56.25 
 
 		 208 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  56.25 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  56.25 
 
 		 199 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  47.94 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  46.91 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  45.83 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  44.1 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  44.79 
 
 		 462 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  42.93 
 
 		 464 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  42.78 
 
 		 471 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  39.27 
 
 		 265 aa  144  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  44.09 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  41.05 
 
 		 502 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  42.7 
 
 		 464 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  39.59 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  41.25 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  43.62 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  39.52 
 
 		 191 aa  121  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  39.43 
 
 		 427 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  43.4 
 
 		 708 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  41.67 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  32.97 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  40.14 
 
 		 447 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  36.87 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  37.25 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  35.06 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 198 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  33.18 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  29.92 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  38.89 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.34 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  36.67 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  36.67 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1666  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  36.14 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.67 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  33.07 
 
 		 329 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  23.68 
 
 		 175 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 1015 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  27.82 
 
 		 449 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  36.7 
 
 		 680 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.41 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 1001 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  36.84 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2709  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  34.15 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.17 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.69 
 
 		 259 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1721  methyltransferase  28.35 
 
 		 234 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  36.84 
 
 		 251 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.97 
 
 		 236 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 309 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 309 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 331 aa  41.6  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  35.09 
 
 		 251 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  35.09 
 
 		 251 aa  41.2  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>