277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4401 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  28.47 
 
 		 1274 aa  62  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.03 
 
 		 1291 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.95 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.95 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.72 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  32.04 
 
 		 1287 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.35 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27490  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  36.84 
 
 		 387 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.33 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 356 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  43.68 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.23 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 351 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  29.63 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  29.63 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.01 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.63 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  31.96 
 
 		 351 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.23 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.25 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.22 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  30.7 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 1116 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 357 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.11 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0134  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.89 
 
 		 440 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  31.86 
 
 		 541 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.54 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.59 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.59 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 542 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 399 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 253 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  32.65 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  25.6 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 351 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 351 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  27.43 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 440 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.81 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.81 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.15 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.81 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.74 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.93 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  29.32 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.5 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1096  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 362 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.46 
 
 		 1144 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  29.82 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  32.11 
 
 		 541 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  35.9 
 
 		 423 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  27.48 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 355 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.45 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3316  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  38.83 
 
 		 431 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  25.31 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.2 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.71 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  30.11 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.8 
 
 		 430 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.01 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  30.6 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.89 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0437  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.67 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3003  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.67 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.85 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  28.43 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  28.83 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0191  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.67 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>