More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1873 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  36.43 
 
 
1225 aa  773    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.01 
 
 
1226 aa  851    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.27 
 
 
1172 aa  675    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 
1287 aa  843    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  38.54 
 
 
1274 aa  874    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
1291 aa  2659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  23.97 
 
 
782 aa  207  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  23.97 
 
 
792 aa  175  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  20.07 
 
 
849 aa  119  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  21.82 
 
 
847 aa  102  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  21.88 
 
 
839 aa  102  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  21.12 
 
 
780 aa  95.9  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  23.55 
 
 
772 aa  95.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  22.27 
 
 
807 aa  95.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  23.19 
 
 
788 aa  93.6  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  21.84 
 
 
783 aa  93.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  22.97 
 
 
784 aa  92  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  22.97 
 
 
784 aa  92  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  22.72 
 
 
805 aa  91.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  21.2 
 
 
778 aa  89  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  21.67 
 
 
802 aa  89  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  21.38 
 
 
802 aa  88.2  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  21.38 
 
 
802 aa  88.2  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.97 
 
 
235 aa  87.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  22.9 
 
 
788 aa  87.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  19.01 
 
 
843 aa  85.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.2 
 
 
231 aa  85.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  22.22 
 
 
804 aa  85.5  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3974  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.78 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000150159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  25.06 
 
 
782 aa  85.1  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  21.4 
 
 
802 aa  85.1  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  21.55 
 
 
823 aa  85.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0363  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.14 
 
 
234 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000581696  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2351  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.68 
 
 
254 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2263  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.68 
 
 
254 aa  83.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3116  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  28.96 
 
 
234 aa  82  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2001  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.51 
 
 
225 aa  82.4  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0508  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.11 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  20.87 
 
 
803 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2629  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.12 
 
 
245 aa  81.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0078972  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4035  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.71 
 
 
258 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4067  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.71 
 
 
258 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3378  acyltransferase family protein  26.27 
 
 
275 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.53 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3927  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.71 
 
 
258 aa  79.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.058142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.15 
 
 
764 aa  79.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  20.35 
 
 
826 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2213  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0965505  hitchhiker  0.00600362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  22.92 
 
 
791 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.15 
 
 
773 aa  78.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1600  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.09 
 
 
254 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0193  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
518 aa  78.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0459706  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  20.32 
 
 
826 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  20.51 
 
 
806 aa  77.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0276  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.86 
 
 
257 aa  77  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  23.68 
 
 
799 aa  77  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  21.12 
 
 
791 aa  76.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0345  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.11 
 
 
282 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  21.72 
 
 
759 aa  76.3  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  22.97 
 
 
794 aa  75.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0326  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.98 
 
 
263 aa  75.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0276  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.09 
 
 
244 aa  75.5  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  25.25 
 
 
845 aa  75.1  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  28.46 
 
 
778 aa  75.1  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3675  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.34 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.264662  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4367  acyltransferase family protein  24.21 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0255  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.09 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.34 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  19.85 
 
 
804 aa  75.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  21.05 
 
 
806 aa  75.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  25.43 
 
 
852 aa  74.3  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4396  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.75 
 
 
232 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000345745  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  20.97 
 
 
828 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0690  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 
264 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157472  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  20.97 
 
 
829 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0265  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.6 
 
 
244 aa  74.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  21.24 
 
 
777 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3684  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.81 
 
 
268 aa  73.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4761  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.81 
 
 
268 aa  73.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.043692  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0348  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.3 
 
 
291 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.13 
 
 
291 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.363645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0343  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.3 
 
 
274 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0983  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.54 
 
 
242 aa  72.8  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0380  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  33.33 
 
 
234 aa  72.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  21.63 
 
 
839 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0341  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.3 
 
 
274 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2499  1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase  33.88 
 
 
244 aa  72.4  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.63 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2618  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.57 
 
 
244 aa  72.4  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0937  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  33.88 
 
 
253 aa  72.4  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3510  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.05 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  31.16 
 
 
380 aa  72  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  20.43 
 
 
810 aa  72  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32744  predicted protein  31.1 
 
 
214 aa  72  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.131887  normal  0.0803599 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  31.06 
 
 
874 aa  71.6  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.88 
 
 
1083 aa  71.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  25.62 
 
 
791 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.72 
 
 
240 aa  71.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1406  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.56 
 
 
229 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1457  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.22 
 
 
225 aa  70.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.211879  normal  0.0393142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>