99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1374 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  59.87 
 
 		 826 aa  840    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  59.87 
 
 		 826 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  58.79 
 
 		 829 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  51.79 
 
 		 784 aa  737    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  100 
 
 		 778 aa  1513    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  58.79 
 
 		 828 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  78.09 
 
 		 782 aa  1130    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  51.79 
 
 		 784 aa  737    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  51.28 
 
 		 784 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  59.34 
 
 		 806 aa  821    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  57.89 
 
 		 810 aa  816    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  59.63 
 
 		 823 aa  834    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  49.67 
 
 		 804 aa  660    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  58.06 
 
 		 827 aa  752    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  57.16 
 
 		 773 aa  698    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  51.22 
 
 		 791 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  51.8 
 
 		 783 aa  738    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  58.48 
 
 		 812 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  45.29 
 
 		 802 aa  568  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  47.63 
 
 		 802 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  35.37 
 
 		 807 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  35.32 
 
 		 788 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  35.4 
 
 		 788 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  35.63 
 
 		 794 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  28.31 
 
 		 805 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  24.35 
 
 		 802 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  24.31 
 
 		 804 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  27.45 
 
 		 806 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  25.53 
 
 		 804 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  27.87 
 
 		 803 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  23.91 
 
 		 799 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  28.13 
 
 		 802 aa  138  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  28.64 
 
 		 802 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  26.67 
 
 		 748 aa  133  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  27.88 
 
 		 778 aa  132  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  25.76 
 
 		 839 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  27.42 
 
 		 768 aa  131  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  24.47 
 
 		 813 aa  131  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  27.27 
 
 		 835 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  27.67 
 
 		 803 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  25.92 
 
 		 799 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  24.96 
 
 		 780 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  27.83 
 
 		 802 aa  124  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  27.83 
 
 		 802 aa  124  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.45 
 
 		 1226 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  29.62 
 
 		 791 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  29.77 
 
 		 840 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  28.17 
 
 		 773 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.08 
 
 		 1172 aa  120  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  30.86 
 
 		 740 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  27.29 
 
 		 847 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  27.29 
 
 		 843 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  25.58 
 
 		 782 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  26.2 
 
 		 834 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  26.25 
 
 		 772 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  26.67 
 
 		 839 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  27.9 
 
 		 777 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  26.61 
 
 		 839 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  27.55 
 
 		 772 aa  109  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  28.33 
 
 		 791 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  28.54 
 
 		 786 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.46 
 
 		 1291 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  23.95 
 
 		 763 aa  91.3  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  24.66 
 
 		 849 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  24.69 
 
 		 839 aa  84  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  21.35 
 
 		 1274 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  20.09 
 
 		 1225 aa  79.7  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  26.83 
 
 		 768 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  26.54 
 
 		 759 aa  70.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  22.02 
 
 		 792 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  26.84 
 
 		 893 aa  60.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  25.97 
 
 		 884 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  26.19 
 
 		 901 aa  57.4  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  23.43 
 
 		 1287 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  25.14 
 
 		 843 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  22.25 
 
 		 847 aa  50.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.4 
 
 		 1045 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.84 
 
 		 886 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0282  hypothetical protein  20.71 
 
 		 742 aa  48.9  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418733  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.84 
 
 		 864 aa  48.5  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  28.9 
 
 		 889 aa  48.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.7 
 
 		 798 aa  47.8  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  29.49 
 
 		 1204 aa  47.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  26.84 
 
 		 881 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  29.74 
 
 		 959 aa  47.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  27.89 
 
 		 806 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.47 
 
 		 764 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.22 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  23.27 
 
 		 767 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  27.73 
 
 		 901 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  23.31 
 
 		 777 aa  45.8  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  22.22 
 
 		 748 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  26.04 
 
 		 972 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  30.13 
 
 		 746 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  28.27 
 
 		 920 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  27.69 
 
 		 862 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.48 
 
 		 747 aa  44.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  25.45 
 
 		 688 aa  43.9  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.86 
 
 		 776 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>