More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3348 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  100 
 
 		 1045 aa  2123    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.61 
 
 		 883 aa  357  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  30.01 
 
 		 892 aa  356  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.16 
 
 		 883 aa  351  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  29.49 
 
 		 920 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.44 
 
 		 886 aa  326  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  28.06 
 
 		 1128 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.5 
 
 		 899 aa  288  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  30.72 
 
 		 893 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  27.86 
 
 		 972 aa  258  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.64 
 
 		 910 aa  254  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  26.5 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  24.44 
 
 		 884 aa  185  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  24.95 
 
 		 889 aa  183  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  25.67 
 
 		 901 aa  179  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  25.03 
 
 		 901 aa  177  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  25.03 
 
 		 862 aa  161  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.92 
 
 		 882 aa  157  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  23.34 
 
 		 862 aa  152  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.56 
 
 		 882 aa  151  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.01 
 
 		 882 aa  147  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  25.32 
 
 		 908 aa  145  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.51 
 
 		 882 aa  145  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  23.97 
 
 		 887 aa  144  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  23.94 
 
 		 872 aa  141  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.39 
 
 		 877 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.92 
 
 		 895 aa  140  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.61 
 
 		 868 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.32 
 
 		 669 aa  139  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  25.45 
 
 		 767 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.33 
 
 		 870 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  23.43 
 
 		 868 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.48 
 
 		 887 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.4 
 
 		 871 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.25 
 
 		 900 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  28.11 
 
 		 871 aa  129  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  21.96 
 
 		 882 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  23.67 
 
 		 879 aa  125  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  23.92 
 
 		 877 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  22.85 
 
 		 868 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.75 
 
 		 877 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  25.1 
 
 		 906 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.85 
 
 		 864 aa  112  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  24.51 
 
 		 877 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  24.51 
 
 		 877 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  29.17 
 
 		 858 aa  108  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  24.5 
 
 		 864 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.62 
 
 		 877 aa  101  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  23.66 
 
 		 877 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  23.75 
 
 		 877 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  34.31 
 
 		 845 aa  99  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1083 aa  91.3  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1079 aa  90.9  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  25.25 
 
 		 877 aa  90.9  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  25.25 
 
 		 877 aa  90.9  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  25.12 
 
 		 969 aa  88.6  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  25.12 
 
 		 877 aa  88.2  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  25 
 
 		 877 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  24.8 
 
 		 877 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  28.63 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  19.95 
 
 		 905 aa  79  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.86 
 
 		 798 aa  78.2  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.68 
 
 		 388 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  25.9 
 
 		 1359 aa  76.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  32.93 
 
 		 832 aa  76.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  32.26 
 
 		 879 aa  75.5  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25.14 
 
 		 385 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.88 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  28.57 
 
 		 923 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  30.47 
 
 		 1287 aa  72  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  25.23 
 
 		 846 aa  71.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  22.06 
 
 		 944 aa  71.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  25.11 
 
 		 840 aa  71.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.46 
 
 		 747 aa  71.2  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  26 
 
 		 805 aa  71.2  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  31.47 
 
 		 1225 aa  70.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  30.3 
 
 		 849 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  23.53 
 
 		 788 aa  70.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  23.53 
 
 		 788 aa  70.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  23.88 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  22.33 
 
 		 840 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  25 
 
 		 845 aa  68.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  31.45 
 
 		 839 aa  67.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  22.52 
 
 		 802 aa  67.4  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.47 
 
 		 758 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.6 
 
 		 778 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  27.04 
 
 		 826 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  27.01 
 
 		 806 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  26.11 
 
 		 1013 aa  66.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  25.49 
 
 		 874 aa  66.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.07 
 
 		 1291 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.42 
 
 		 1172 aa  65.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  24.26 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  34.96 
 
 		 843 aa  65.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  22.39 
 
 		 843 aa  65.5  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  31.54 
 
 		 855 aa  65.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  22.39 
 
 		 847 aa  65.5  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  31.41 
 
 		 862 aa  65.1  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  24.91 
 
 		 1022 aa  65.1  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  24.91 
 
 		 1022 aa  65.1  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>