122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0430 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  76.77 
 
 		 791 aa  1138    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  75.95 
 
 		 791 aa  1117    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  100 
 
 		 777 aa  1516    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  33.82 
 
 		 763 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  30.65 
 
 		 805 aa  278  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  28.33 
 
 		 780 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  29.51 
 
 		 839 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  30.54 
 
 		 802 aa  267  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  29.65 
 
 		 799 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  32.6 
 
 		 786 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  30.13 
 
 		 804 aa  260  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  30.64 
 
 		 803 aa  260  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  29.97 
 
 		 802 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  30.01 
 
 		 806 aa  257  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  30.29 
 
 		 804 aa  248  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  28.7 
 
 		 778 aa  248  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  29.61 
 
 		 803 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  28.18 
 
 		 802 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  30.26 
 
 		 839 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  29.19 
 
 		 839 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  31.63 
 
 		 748 aa  237  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  32.29 
 
 		 768 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  28.72 
 
 		 813 aa  233  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  28.54 
 
 		 834 aa  232  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  28.11 
 
 		 835 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  30.96 
 
 		 799 aa  228  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  30.39 
 
 		 841 aa  228  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  30.09 
 
 		 802 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  30.09 
 
 		 802 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  27.94 
 
 		 840 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  27.59 
 
 		 843 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  27.34 
 
 		 847 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3914  putative lipoprotein transmembrane  31.85 
 
 		 784 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  30.15 
 
 		 773 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  31.31 
 
 		 768 aa  206  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  29.15 
 
 		 772 aa  204  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0976  KWG  25.98 
 
 		 749 aa  189  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0282  hypothetical protein  23.19 
 
 		 742 aa  172  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  28.44 
 
 		 772 aa  170  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  27.16 
 
 		 802 aa  140  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  31.95 
 
 		 740 aa  136  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  20 
 
 		 759 aa  130  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  28.03 
 
 		 807 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  27.73 
 
 		 788 aa  117  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  27.47 
 
 		 788 aa  114  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  24.66 
 
 		 783 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  26.43 
 
 		 784 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  26.43 
 
 		 784 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  27.07 
 
 		 802 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  26.48 
 
 		 794 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  26.86 
 
 		 806 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  24.37 
 
 		 804 aa  94.7  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  27.39 
 
 		 810 aa  94.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  24.86 
 
 		 826 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  21.82 
 
 		 1225 aa  90.1  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  24.63 
 
 		 826 aa  90.1  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.21 
 
 		 1172 aa  88.2  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  24.47 
 
 		 823 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  27.07 
 
 		 791 aa  84.7  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.45 
 
 		 1291 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  27.49 
 
 		 778 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  30.56 
 
 		 782 aa  81.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  19.89 
 
 		 1226 aa  77.8  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  29.26 
 
 		 773 aa  67.4  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  29.93 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  29.25 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.84 
 
 		 812 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  18.17 
 
 		 1274 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  35.58 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  26.69 
 
 		 881 aa  57.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  29.25 
 
 		 874 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  23.91 
 
 		 862 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.83 
 
 		 1045 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  27.68 
 
 		 845 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.95 
 
 		 871 aa  54.3  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  25.98 
 
 		 901 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.77 
 
 		 864 aa  52  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  23.72 
 
 		 890 aa  51.6  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  30.61 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  22.75 
 
 		 862 aa  51.6  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  24.86 
 
 		 871 aa  50.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  22.37 
 
 		 1287 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  24.14 
 
 		 901 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  27.09 
 
 		 782 aa  50.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  24.83 
 
 		 380 aa  50.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.81 
 
 		 870 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  23.42 
 
 		 972 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  21.47 
 
 		 884 aa  48.5  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  32.35 
 
 		 826 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  27.89 
 
 		 1131 aa  48.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  25.45 
 
 		 786 aa  47.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  22.95 
 
 		 868 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  30.14 
 
 		 828 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  30.14 
 
 		 829 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  20.91 
 
 		 689 aa  47.8  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 827 aa  47.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  26.95 
 
 		 893 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  24.31 
 
 		 868 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  20.57 
 
 		 887 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>