More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3221 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1738    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  41.1 
 
 		 895 aa  606  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  36.54 
 
 		 1011 aa  534  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  40.95 
 
 		 1131 aa  493  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  41.21 
 
 		 1204 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  36.07 
 
 		 855 aa  472  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  36.11 
 
 		 862 aa  462  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  36.09 
 
 		 872 aa  458  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  35.27 
 
 		 862 aa  443  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  31.59 
 
 		 805 aa  331  4e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  30.87 
 
 		 860 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  31.49 
 
 		 832 aa  313  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  30.23 
 
 		 923 aa  311  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  29.8 
 
 		 842 aa  307  6e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  35.25 
 
 		 1109 aa  303  9e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  28.95 
 
 		 1359 aa  284  4.0000000000000003e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  29.49 
 
 		 879 aa  240  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.85 
 
 		 764 aa  178  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  25.12 
 
 		 748 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.1 
 
 		 747 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.24 
 
 		 864 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  27.3 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  30.63 
 
 		 388 aa  127  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  23.72 
 
 		 752 aa  122  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.28 
 
 		 385 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  25.2 
 
 		 865 aa  111  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  27.63 
 
 		 385 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  27.45 
 
 		 385 aa  108  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.24 
 
 		 755 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  24.51 
 
 		 800 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.48 
 
 		 752 aa  99  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.88 
 
 		 807 aa  97.8  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  27.68 
 
 		 387 aa  97.8  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.1 
 
 		 808 aa  97.8  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.09 
 
 		 792 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  24.48 
 
 		 811 aa  94  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.24 
 
 		 1051 aa  91.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  30.28 
 
 		 905 aa  90.9  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.55 
 
 		 835 aa  90.5  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  23.81 
 
 		 694 aa  89  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  30.99 
 
 		 778 aa  88.2  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  34.78 
 
 		 845 aa  88.2  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.94 
 
 		 806 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  28.33 
 
 		 898 aa  85.9  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  31.65 
 
 		 839 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  32.19 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  33.13 
 
 		 849 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25.31 
 
 		 812 aa  82  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  35.83 
 
 		 921 aa  79.7  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.98 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  36.17 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20 
 
 		 1226 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  23.92 
 
 		 792 aa  78.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  32.64 
 
 		 756 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  23.23 
 
 		 799 aa  77.8  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  32.65 
 
 		 859 aa  77.8  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.84 
 
 		 727 aa  77.8  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  20.36 
 
 		 821 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.24 
 
 		 756 aa  77  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  29.3 
 
 		 843 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  20.96 
 
 		 791 aa  77  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  36.29 
 
 		 889 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  20.18 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  28.9 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  23.44 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1083 aa  74.3  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.15 
 
 		 869 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.57 
 
 		 779 aa  73.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.97 
 
 		 831 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  20.32 
 
 		 799 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  24.26 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.7 
 
 		 869 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  20.32 
 
 		 799 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  24.76 
 
 		 808 aa  72.8  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  25.99 
 
 		 777 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  31.63 
 
 		 779 aa  72  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  20.28 
 
 		 799 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  25.53 
 
 		 861 aa  71.6  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  19.93 
 
 		 789 aa  70.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.06 
 
 		 1291 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  23.53 
 
 		 815 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  20.85 
 
 		 796 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  24.33 
 
 		 790 aa  70.1  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  21.22 
 
 		 800 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  21.11 
 
 		 790 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  21.72 
 
 		 1287 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  30.89 
 
 		 692 aa  68.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  27.81 
 
 		 777 aa  68.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  34.21 
 
 		 847 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  23.22 
 
 		 797 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  31.14 
 
 		 893 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  21.11 
 
 		 793 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.14 
 
 		 764 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  25.5 
 
 		 816 aa  66.6  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  33.83 
 
 		 792 aa  67  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  38.61 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.7 
 
 		 758 aa  67  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  24.21 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.74 
 
 		 1045 aa  66.6  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  33.1 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>