298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0209 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  46.62 
 
 		 865 aa  706    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  47.07 
 
 		 860 aa  719    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  100 
 
 		 881 aa  1771    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  45.21 
 
 		 877 aa  716    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.23 
 
 		 905 aa  161  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.23 
 
 		 807 aa  149  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  19.82 
 
 		 898 aa  146  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.74 
 
 		 837 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  23.1 
 
 		 869 aa  128  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  23.1 
 
 		 869 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  20.47 
 
 		 789 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.79 
 
 		 792 aa  124  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1083 aa  122  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  29.93 
 
 		 778 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.13 
 
 		 764 aa  117  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.08 
 
 		 1051 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  21.47 
 
 		 872 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.92 
 
 		 767 aa  108  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.42 
 
 		 824 aa  108  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  26.97 
 
 		 800 aa  108  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26.21 
 
 		 755 aa  103  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.73 
 
 		 779 aa  101  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.51 
 
 		 801 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  30.45 
 
 		 751 aa  100  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  19.98 
 
 		 830 aa  99.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  24.07 
 
 		 792 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  25.62 
 
 		 811 aa  98.6  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.24 
 
 		 815 aa  98.6  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.36 
 
 		 764 aa  97.8  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.81 
 
 		 779 aa  95.5  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  22.22 
 
 		 859 aa  94  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.01 
 
 		 861 aa  92.4  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.68 
 
 		 756 aa  89.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  19.2 
 
 		 828 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.24 
 
 		 831 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  22.71 
 
 		 813 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.45 
 
 		 835 aa  84  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  23.96 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  24.23 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  23.96 
 
 		 806 aa  82.4  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.18 
 
 		 806 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  25.66 
 
 		 763 aa  80.9  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  19.4 
 
 		 823 aa  79.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  20.88 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.72 
 
 		 808 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  18.64 
 
 		 815 aa  79.3  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  23.26 
 
 		 796 aa  79  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  22.33 
 
 		 385 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  18.85 
 
 		 823 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  22.33 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  18.58 
 
 		 823 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  20.84 
 
 		 385 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  19.5 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.47 
 
 		 727 aa  72  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.76 
 
 		 816 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.15 
 
 		 762 aa  70.1  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  17.1 
 
 		 797 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  18.41 
 
 		 773 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  27.51 
 
 		 825 aa  70.1  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.79 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  21.21 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.15 
 
 		 886 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  24.85 
 
 		 765 aa  67.8  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  20.58 
 
 		 674 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.18 
 
 		 717 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  20 
 
 		 808 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  24.34 
 
 		 1011 aa  65.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  24.66 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.54 
 
 		 788 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.07 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  20.99 
 
 		 800 aa  64.7  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  30.83 
 
 		 1063 aa  63.9  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.4 
 
 		 723 aa  63.9  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  20.59 
 
 		 788 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.14 
 
 		 1204 aa  62.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.38 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  18.72 
 
 		 674 aa  62.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  25.77 
 
 		 862 aa  62  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  23.65 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  18.56 
 
 		 791 aa  59.7  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  23.66 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.58 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.13 
 
 		 803 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  23.12 
 
 		 805 aa  60.1  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  23.12 
 
 		 805 aa  60.1  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  24.06 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  22.05 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  24.66 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  22.12 
 
 		 1131 aa  58.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  24.43 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  25.67 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  24.2 
 
 		 772 aa  58.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  24.14 
 
 		 1146 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  20.99 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  27.98 
 
 		 1128 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.3 
 
 		 756 aa  57.4  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  22.16 
 
 		 879 aa  57  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.11 
 
 		 895 aa  57  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  22.67 
 
 		 889 aa  56.6  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>