More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1747 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  100 
 
 		 901 aa  1798    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  41.38 
 
 		 890 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  40.18 
 
 		 884 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  39.14 
 
 		 901 aa  581  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  36.58 
 
 		 889 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.61 
 
 		 887 aa  485  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.4 
 
 		 882 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  37.73 
 
 		 767 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.79 
 
 		 882 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  34.29 
 
 		 862 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.05 
 
 		 895 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.56 
 
 		 882 aa  432  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.92 
 
 		 882 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.53 
 
 		 868 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.53 
 
 		 882 aa  422  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.11 
 
 		 900 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  36.11 
 
 		 879 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.67 
 
 		 864 aa  415  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  34.27 
 
 		 872 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  34.14 
 
 		 887 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.75 
 
 		 871 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  33.74 
 
 		 862 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  34.36 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.02 
 
 		 870 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  33.14 
 
 		 871 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.52 
 
 		 877 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.07 
 
 		 877 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  33.37 
 
 		 868 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  32.95 
 
 		 877 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  32.95 
 
 		 877 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  33.11 
 
 		 877 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  33.11 
 
 		 877 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1079 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  32.99 
 
 		 969 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  33.11 
 
 		 877 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1083 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  33.11 
 
 		 877 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  33.79 
 
 		 877 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  33.86 
 
 		 877 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  33.03 
 
 		 877 aa  366  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.92 
 
 		 877 aa  365  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  32.9 
 
 		 868 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  33.41 
 
 		 877 aa  360  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  35.66 
 
 		 864 aa  350  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  33.73 
 
 		 858 aa  347  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.92 
 
 		 669 aa  342  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  30.26 
 
 		 1128 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  30.03 
 
 		 899 aa  326  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.99 
 
 		 883 aa  326  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  30.18 
 
 		 920 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  28.67 
 
 		 892 aa  320  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.46 
 
 		 886 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.1 
 
 		 883 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  28.06 
 
 		 893 aa  261  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  26.05 
 
 		 910 aa  249  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  27.45 
 
 		 972 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.35 
 
 		 1045 aa  194  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  23.33 
 
 		 906 aa  145  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  26.48 
 
 		 849 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  28.93 
 
 		 845 aa  98.6  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.37 
 
 		 798 aa  84.7  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  26.12 
 
 		 800 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  32.75 
 
 		 843 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.8 
 
 		 837 aa  77.4  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  34.44 
 
 		 839 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  32.43 
 
 		 380 aa  77  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  24.44 
 
 		 806 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  32.26 
 
 		 847 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  22.64 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  39.25 
 
 		 782 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  32.31 
 
 		 1359 aa  70.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.17 
 
 		 874 aa  69.7  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  24.62 
 
 		 840 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  26.19 
 
 		 811 aa  69.7  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.73 
 
 		 821 aa  69.7  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.54 
 
 		 1226 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  26.55 
 
 		 767 aa  68.9  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  25.15 
 
 		 846 aa  68.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  25.15 
 
 		 840 aa  67.8  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.83 
 
 		 882 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  24.37 
 
 		 845 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  30.26 
 
 		 385 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.09 
 
 		 905 aa  67  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.26 
 
 		 1172 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  28.95 
 
 		 385 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  29.33 
 
 		 385 aa  67  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  31.85 
 
 		 862 aa  66.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  31.18 
 
 		 1204 aa  65.1  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  32 
 
 		 864 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.83 
 
 		 792 aa  64.3  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  32.06 
 
 		 792 aa  64.3  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  27.38 
 
 		 831 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.58 
 
 		 815 aa  63.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  23.76 
 
 		 808 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.79 
 
 		 764 aa  62.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  28.57 
 
 		 923 aa  62  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  30 
 
 		 855 aa  62  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  27.8 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  24.23 
 
 		 778 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.41 
 
 		 1291 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>