128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0331 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  75.51 
 
 		 834 aa  1137    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  94.2 
 
 		 847 aa  1473    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  75.33 
 
 		 839 aa  1139    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  74.7 
 
 		 839 aa  1169    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  53.27 
 
 		 802 aa  756    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  75.21 
 
 		 839 aa  1138    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  93.17 
 
 		 840 aa  1430    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  53.36 
 
 		 841 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  90.16 
 
 		 813 aa  1398    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  100 
 
 		 835 aa  1667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  56.08 
 
 		 804 aa  831    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  53.82 
 
 		 804 aa  778    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  94.41 
 
 		 843 aa  1473    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  55.43 
 
 		 799 aa  823    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  49.68 
 
 		 799 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  34.85 
 
 		 780 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  33.01 
 
 		 778 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  29.91 
 
 		 805 aa  301  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  32.17 
 
 		 786 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  31.99 
 
 		 768 aa  290  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  31.72 
 
 		 802 aa  280  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  31.89 
 
 		 803 aa  277  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  31.48 
 
 		 806 aa  275  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  31.46 
 
 		 748 aa  273  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  29.21 
 
 		 802 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  29.21 
 
 		 802 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  28.81 
 
 		 791 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  30.4 
 
 		 773 aa  262  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3914  putative lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 		 784 aa  261  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  29.72 
 
 		 772 aa  256  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  30.76 
 
 		 772 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  28.72 
 
 		 791 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  27.95 
 
 		 777 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  28.85 
 
 		 802 aa  235  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  28.76 
 
 		 803 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  31.14 
 
 		 768 aa  223  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  22.55 
 
 		 759 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  26.24 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  24.34 
 
 		 802 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  26.16 
 
 		 807 aa  144  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  24.12 
 
 		 806 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  27.43 
 
 		 740 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  24 
 
 		 804 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  24.78 
 
 		 810 aa  138  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  24.44 
 
 		 794 aa  137  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  23.84 
 
 		 828 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  23.84 
 
 		 829 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  23.79 
 
 		 826 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  24.15 
 
 		 826 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  23.6 
 
 		 783 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0976  KWG  24.53 
 
 		 749 aa  126  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  26.51 
 
 		 782 aa  125  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  24.03 
 
 		 784 aa  124  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  24.03 
 
 		 784 aa  124  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  26.67 
 
 		 788 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  24.9 
 
 		 823 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  26.15 
 
 		 788 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  25.24 
 
 		 784 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.99 
 
 		 812 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  26.49 
 
 		 778 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  25.65 
 
 		 827 aa  101  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0282  hypothetical protein  21.52 
 
 		 742 aa  98.2  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  24.87 
 
 		 773 aa  97.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  22.47 
 
 		 791 aa  90.9  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  24.19 
 
 		 802 aa  85.5  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  26.42 
 
 		 782 aa  85.5  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  18.81 
 
 		 1226 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  18.93 
 
 		 1225 aa  75.1  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2104  exporter-like protein  22.51 
 
 		 704 aa  70.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.85 
 
 		 882 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.47 
 
 		 1172 aa  68.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  26.41 
 
 		 910 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  22.48 
 
 		 839 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.85 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  24.53 
 
 		 871 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  22.53 
 
 		 892 aa  64.3  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  20.72 
 
 		 1045 aa  62.4  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.45 
 
 		 1291 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  22.49 
 
 		 847 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  25.08 
 
 		 893 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  23.04 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  25.37 
 
 		 972 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  23.85 
 
 		 849 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  22.92 
 
 		 901 aa  55.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  23.78 
 
 		 862 aa  54.7  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  22.19 
 
 		 1274 aa  54.3  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.36 
 
 		 874 aa  53.9  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.01 
 
 		 388 aa  53.5  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  23.56 
 
 		 752 aa  52.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.16 
 
 		 886 aa  52.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.71 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  22.49 
 
 		 872 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.56 
 
 		 807 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.45 
 
 		 758 aa  48.5  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.74 
 
 		 864 aa  48.5  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  25.74 
 
 		 387 aa  48.5  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.08 
 
 		 882 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.81 
 
 		 870 aa  48.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  26.23 
 
 		 901 aa  47.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  28.9 
 
 		 812 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>